亚特兰蒂斯的灭亡，人们相信与大洪水有关。史前大洪水，是指史前时代地球突然被来历不明的海啸包围，强而有力的洪水，使高山在波涛中颤抖，陆地在巨变中呻吟……以雷霆万钧之势，咆哮着冲向陆地，吞没了城市谷地，以及地球上的所有生灵。
有人认为是人类传讹附会的记忆，也有人认为是千真万确的事实。孰是孰非，千百年来仍无定论。
在有关于亚特兰蒂斯覆灭的记载中，古代墨西哥着作抄本(即《梵蒂冈城国古抄本》)记录着人类文明毁灭于巨浪滔天的大洪灾。亚特兰蒂斯沉没于大西洲。而且亚特兰蒂斯沉没的时间节点与大洪水出现的时间节点相吻合。
英国的民族学家弗雷泽曾指出：在北美洲，中美洲，南美洲的130多个印第安种族中，没有一个种族没有以大洪水为主题的神话。事实上，记录大洪水的并不限于美洲的印第安人，在世界各大陆上生活的民族中几乎都有关于大洪水的记载。大约1万2千年前左右，上一期人类文明曾遭受一次特大洪水的袭击，那次洪水也导致大陆的下沉。考古学家陆续发现了许多那次大洪水的直接和间接证据。人类文化学家也通过研究世界各地不同民族关于本民族文明起源的传说则发现：世界各地不同民族的古老传说都普遍
述及人类曾经历过多次毁灭性大灾难，并且如此一致地记述了在我们本次人类文明出现之前的某一远古时期，地球上曾发生过一次造成全人类文明毁灭的大洪水，而只有极少数人得以存活下来。全世界已知的关于大洪水的传说有600多则。例如，中国及日本、马来西亚、老挝、泰国、印度、澳大利亚、希腊、埃及及非洲、南美洲、北美洲的土著等各个不同国家和民族的传说中都保留着对一场大洪水的记忆。
虽然这些传说产生于自各个不同的民族、文化，却拥有极其相似的故事情节和典型人物。对于这一切证据和现象，用偶然或巧合是根本无法解释的。
在世界上任何一个有足够时间跨度的民族的历史和传说中，都有着惊人相似的“大洪水”传说。而且在传说中的时间、地点、人物、内容都有着惊人的相似之处!综上所述，我们是否能得出这样一个结论：一、 大洪水确实发生过，二、 一种巨大的能量的突然作用，导致了这次“史前大洪水”或者更确切的说，是“史前全球性海浸事故”。而如此巨大的能量，应当而且只能来自于我们的星球之外。三、这次“史前大洪水”造成了一个史前文化断层，就像传说中消失的“亚特兰蒂斯”。
一项研究证实，早在8000多年前北大西洋巨大冰盖的融化曾使海平面大幅上升，科学家指出，据西班牙《世界报》25日报道，英国埃克塞特大学和澳大利亚伍伦贡大学的科学家指出，发生在距今8740年至8160年间的北美劳伦太德冰盖融化，造成了近10万年来地球上最大规模的淡水增加，地中海海平面也因此上升了1.4米。
研究指出，海平面的上升导致当时还是一个淡水湖的黑海被咸水淹没，造成黑海海水在大约8200年以前增多变咸。生活在黑海沿岸一带的新石器时代的农业人口受影响最大，他们无法继续耕作。洪水最严重时，有72700平方公里的土地被淹，这一时期持续了约30多年。同样的现象还出现在地中海沿岸，大约1120平方公里的土地被水淹没。这一切造成了14.5万人类向西迁移，寻找更适合的耕地。
他们的到来加速了当地的社会变革，推动了生活方式的改变，这很可能是早期农业向欧洲其他地区传播的过程。研究小组负责人英国教授克里斯·特尼指出，这一事件被代代相传，给人留下的印象是全世界都发生了大洪水。这一事件可能是《圣经》中记载的诺亚方舟拯救人类的故事起源。
