清收复新疆之战是晚清钦差大臣左宗棠统帅清军，消灭侵占新疆的阿古柏势力、维护中国主权和领土完整的战争，又称左宗棠收复新疆。
历史背景
第二次鸦片战争之前，沙皇俄国就已侵占了中国西北部的斋桑湖地区和浩罕、布哈拉等中亚小汗国的大片地区。趁第二次鸦片战争中国处于劣势的境况，沙俄出兵占领了中国的巴尔喀什湖东南的塔拉塔勒河、伊犁河等七河地区，迫使中国清政府签订了《中俄伊犁塔尔巴哈台通商章程》，沙俄得到了在伊犁、塔城地区的通商、贸易免税、自由居住、传教等特权。
1864年，沙俄再与清政府签订《中俄勘分西北界约记》，沙俄成功取得伊塞克湖和巴尔喀什湖以东以南地区。
此时正值太平天国运动和同治陕甘回变波及新疆，新疆各地豪强趁机而起，出现了割据纷争，各自为王的混乱局面。喀什噶尔由伊斯兰教白山派首领马木提艾来木占据称王。不久，柯尔克孜族部落钦察头目司迪克联络回族封建主金相印，在混乱中夺取了喀什噶尔称王，赶跑了马木提艾来木。马木提艾来木致书中亚的浩罕汗国，欲借助外部势力驱逐司迪克。司迪克也派出金相印亲自到浩罕进行联系，想把流亡浩罕的黑山派和卓后裔布素鲁克请回喀什噶尔，对抗马木提艾来木。1865年春，浩罕汗国派军事头目阿古柏护送布素鲁克去见司迪克。
阿古柏和布素鲁克一到喀什噶尔立刻组织兵变赶走了司迪克，于1865年底以喀什噶尔为中心，成立了“哲德沙尔汗国”政权。1867年，阿古柏抛开布素鲁克自行建立“洪福汗国”一统南疆。1870年，阿古柏攻占了吐鲁番，切断了北疆和河西走廊之间的联系，并收降了以白彦虎为首的陕甘回军残部，实力进一步增强。到1871年底，迪化、玛纳斯、鄯善先后被阿古柏攻克。同年俄国出兵占领伊犁。这样，清军除塔城、乌苏等少数据点外，已经被迫全部从新疆撤退。
战争过程
战前清军的准备
同治十一年(1872年)七月，清廷尚在争论征伐阿古柏之事，左宗棠认为“既事关君国，兼涉中外，不能将就了局，且索性干去而已”，率所部湘军进驻兰州，准备收复新疆。
左宗棠的准备工作做得非常专业和充足。他采用“缓进急战”的策略。“缓进”，就是用一年半的时间筹措军饷，积草屯粮，整顿军队，减少冗员，增强了军队的战斗力。即使是自己的主力湘军，也剔除空额，汰弱留强。他还规定，凡是不愿出关西征的，一律给资，遣送回籍，不加勉强。留下来自愿出关的部队，是一支士气高涨的精兵。“急战”，就是考虑国库空虚，为了紧缩军费开支，大军一旦出发，必须速战速决，力争在一年半左右获取全胜尽早收兵。左宗棠在深入调查及详细计算后，估算出全部军费开支共需白银八百万两。为防止意外，做到留有余地，他向朝廷申报一千万两，当时主管财政的大臣沈葆祯一见西征军费的预算报告，就想摊派给各省，从地方财政收入里抽调，可是这样一来就很难一时凑齐，会贻误战机。军机大臣文祥过问了这件事，他亲自去找皇帝和摄政的西太后陈述利害关系。皇帝御批道：“宗棠乃社稷大臣，此次西征以国事而自任，只要边地安宁，朝廷何惜千万金，可从国库拨款五百万，并敕令允其自借外国债五百万。”
左宗棠同时在兰州建立“兰州制造局”(亦称“甘肃制造局”)，为西征军修造枪炮。为了对付阿古柏军的洋枪洋炮，左宗棠从广州、浙江调来专家和熟练工人，在兰州造出大量先进武器，还仿造了德国的螺丝炮和后膛七响枪，改造了中国的劈山炮和广东无壳抬枪。新疆收复后，上海“泰来洋行”的德国技师福克曾在哈密与左宗棠会面，观看了部队的演练，见湘军纪律严明，操练得法，军火枪炮也不落后，于是感慨地说：“清军若与俄国交战于伊犁，必获全胜。”当然了这种说法只可一听，甲午战争前大部分西方观察者都认为中国将获胜。左宗棠同时又建“甘肃织呢总局”(亦称“兰州机器织呢局”)，这是中国第一个机器纺织厂。
光绪元年(1875年)，朝廷上争议出兵收复新疆，引起“海防”与“塞防”之争。李鸿章等主张放弃塞防，将“停撤之饷，即匀作海防之饷”。左宗棠力表异议，指出西北“自撤藩篱，则我退寸而寇进尺”，尤其招致英、俄渗透。李鸿章等认为：自从乾隆年间平定新疆一百多年以来，每年都要花费数百万两饷银，这是一个填不满的无底洞，现在又要竭尽天下的财力去赡养大军西征，还不如依从英国人提出的条件，允许阿古柏政权独立，只要他答应称臣入贡就是了。左宗棠则全力反驳李鸿章，他认为：如果丢失新疆，则这块土地不是被西方的英国势力所控制，就是被北方的沙皇俄国鲸吞，中国随即失去西北边防的关卡要塞和重镇，使西北边防无以屏障，到时中国边防的兵力不但不能削减，反而会大大增加。从全局来看，不战而丢新疆的后果，对内必将严重有损国威，丧失民心;对外也必将助长列强的侵略气焰，不利于海防。所以李鸿章的主张乃是误国之计，绝不可行。当时的军机大臣文祥被左宗棠所说服，全力支持之：“老臣以为宗棠之言深谋远虑，上承先皇高宗之遗志，下惠子孙万代，请陛下决策。”于是光绪皇帝和摄政的西太后下诏授左宗棠为钦差大臣，全权节制三军，以将军金顺为副帅，择机出塞平叛新疆。
左宗棠的收复新疆战略是先攻北疆的乌鲁木齐：“关内关外用兵虽有次第，然谋篇布局须一气为之。以大局论，关内肃清，总督应移驻肃州，调度军食以规乌鲁木齐。乌鲁克复，总督应进驻巴里坤以规伊犁。”。他指出，要提防“俄人狡谋”，必先安定新疆回部，“欲收伊犁，必先克乌鲁木齐”。如果乌鲁木齐城克服，“我威维扬”，再大兴屯田以保证长期后勤供应，安抚新疆各部族耕牧如常。如此，“即不遽索伊犁，而已稳然不可犯矣。乌城形势既固，然后明示以伊犁我之疆索，尺寸不可让人”。在战术上，左宗棠也精心分析：“俄虽国大兵强，难与角力，然苟相安无事，固以度外置之。至理喻势禁皆穷，自有不得已而用兵之日，如果整齐队伍，严明纪律，精求枪炮，统以能将，岂必不能转弱为强，至此劳师袭远之寇乎?”因此，“不在先索伊犁，而在急取乌鲁木齐。”左宗棠事先命西征军前锋部队统帅张曜，驻军哈密兴修水利、屯田积谷。1876年一年就收获粮食五千一百六十余石，基本上可以解决该部半年军粮所需。为运输军粮，左宗棠又建立了三条路线：一是从甘肃河西采购军粮，出嘉峪关，过玉门，运至新疆的哈密，二是由包头、归化经蒙古草原运至新疆巴里坤或古城(今奇台)，三是从宁夏经蒙古草原运至巴里坤。
阿古柏的外援
英国驻印度总督派印度康格拉茶园主英国人罗伯特·沙敖到喀什噶尔，援建阿古柏一座兵工厂，并赠送大量武器弹药。同治十一年(1873年)，英国使团到喀什噶尔，向阿古柏送交了维多利亚女王的亲笔信与各种赠品，其中包括各种枪支和二门小炮，并于次年签订出卖中国的《英阿条约》(《英国─喀什噶尔条约》)。沙俄则派出索莫夫与莫罗佐夫兄弟的两支商队，自吐尔尕特山口运送大批军火到喀什噶尔，交阿古柏军队使用。1875年，英国人从印度给阿古柏一次运去连发枪2.2万支(一说2,200支)，山炮8门，炮弹2000发。希望阿古柏作为自己对抗沙俄的棋子。
阿古柏外甥阿吉托拉(亦名赛义德·阿古柏)、喀孜汗土烈去彼得堡面见沙皇道谢，在1873年返回时又到了奥斯曼帝国，表示愿意附属，赠送绸缎、蒙古马、哈萨克的好马各九匹。土耳其苏丹阿卜杜勒-阿齐兹一世是泛突厥主义者，他隆重地接待了阿古柏派去的代表团，并赏给阿古柏“米拉胡尔巴什”(即埃米尔，国王的意思)的职衔。土耳其给阿古柏派遣了上校司马衣艾柯克、艾里卡孜木和木拉提伯克等二十多个高级军事人员和政治顾问，并带来了许多武器和礼品。顾问中有七人留在阿古柏身边常任参谋职务。阿卜杜勒-阿齐兹一世答应阿古柏，在他之后，王位由自己的儿子世袭。特颁古兰经一卷、奥斯曼帝国国旗一面及其他赠品多种。1875年阿古柏从土耳其一次购得新式步枪1.2万支，火炮8门。
清军收复北疆
到1876年4月出兵时，左宗棠指挥的西征军有刘锦棠所部湘军25个营，张曜所部14个营和徐占彪所部蜀军5个营，包括原在新疆各个据点的清军，共有马、步、炮军一百五十余营，兵力总数近八万人。但真正开往前线作战的只有五十余营，二万多人。行军期间要经过著名的莫贺延碛大沙漠，流沙数百里，水源缺乏，唯有把部队分批分期地行进。左宗棠坐镇肃州(今甘肃酒泉)，命刘锦棠、金顺分兵两路，先后率师出关。他把大军分作千人一队，隔日进发一队，刘锦棠走北路，金顺走南路，到哈密会齐。刘锦棠率领西征军主力自肃州入新，至哈密行程约1700里，很顺利地进入哈密。部队各营到达哈密后，把从肃州等地陆续运往哈密的军粮再辗转搬运，翻过东天山九曲险道，分运至巴里坤和古城(今奇台)的金顺部。很快，刘锦棠的前锋部队，已占据了距离乌鲁木齐只有不足三百里的济木萨(今吉木萨尔县)。
阿古柏获晓清军西进的消息后，忙令马人得、马明、白彦虎等分守乌鲁木齐等北疆要地，阻击清军;其主力2万余人部署在吐鲁番和托克逊，阿古柏则坐阵托克逊督战。
8月上旬，刘锦棠、金顺二部迫近乌鲁木齐北面重地古牧地(今米泉)。清除敌军外围据点后，用开花大炮轰塌城墙，8月17日，清军从缺口攻入城内，经过数天激战，占领了古牧地。随后清军乘胜追剿，收复了乌鲁木齐。叛军二号首领白彦虎逃到托克逊。金顺继续率军西进，昌吉、呼图壁和玛纳斯北城的守敌闻风而逃，9月初，金顺部队攻打玛纳斯南城，久攻不克。后来刘锦棠、伊犁将军荣全先后率兵增援，于11月6日攻克该城。至此，清军收复了天山以北的全部阿古柏军占领之地。
清军收复南疆
1877年4月14日，清军休整了几个月后，向南疆进军。刘锦棠率主力从乌鲁木齐南下，16日进至达坂城外围并迅速包围该城。4月18日，清军在达坂城外增筑炮台。4月19日清军开炮，并击中敌弹药库，敌军死伤很多，企图突围未遂，只得投降。达坂城收复。
同时，张曜部队和徐占彪部队在盐池会师后，连克腾木、克辟展、胜金台，直逼吐鲁番。4月26日，刘锦棠部队攻克托克逊。叛军一号首领阿古柏逃往焉耆，留下他的小儿子驻守库尔勒为其垫后。随后，张曜部队和徐占彪部队在罗长祐所率的湘军的协助下收复吐鲁番。此时，通往南疆的门户大开，南疆地区纷纷起来反对阿古柏的统治。阿古柏之后神秘地饮毒酒身亡。白彦虎率领余众逃窜到开都河一带。阿古柏的长子胡里为争权夺位杀死其弟，率领残部逃到喀什噶尔称王，继续与清军对峙。
这时李鸿章等又使朝廷发出敕令：“廷臣聚议，西征耗费巨款，今乌城、吐鲁番既得，可以休兵。”左宗棠看罢大不以为然，于是又上疏抗旨，据理力争。摄政的西太后看罢他的奏章，被说服，于是才继续新疆收复战。此时，沙俄又和土耳其发生战争，金顺建议乘虚袭取被沙俄霸占的伊犁。左宗棠认为师出无名，反遭其谤，留下不打。
9月，清军继续从正道向西挺进，敌守军闻风后，放弃焉耆、喀喇沙尔和库尔勒向西逃往库车。10月18日，刘锦棠部队攻克库车，白彦虎率余部向西逃跑。10月19日，刘锦棠继续西进。24日，清军克阿克苏城。26日克乌什。至此南疆东四城收复。
清军的进军使西南疆四城叶尔羌(今莎车)、英吉沙尔(今英吉沙)、和阗(今和田)、喀什噶尔的守军惊恐万分，内部分崩离析，已降敌军的前喀什噶尔守备何步云亦乘机反正，率领数百满汉兵民占据喀什噶尔汉城。刘锦棠闻讯后，立即挥师分路前进，于12月中下旬先后收复喀什噶尔、叶尔羌、英吉沙尔、和阗。阿古柏的长子胡里与白彦虎逃往俄国。至此，这场由英、俄两国支持的叛乱活动乃告平息。见此情景，住在山中的布鲁特(今柯尔克孜族)十四个部落，也争相内附。除伊犁外，新疆全境被收复。
伊犁谈判
1871年(同治十年)，俄军悍然侵占伊犁后，沙皇政府估计清廷根本无力收复新疆，曾假惺惺地表示：“俟关内肃清，乌鲁木齐、玛纳斯各城克复之后，即当交还。”出乎沙俄意料，中国军民竟在1876至1877年(光绪二年至三年)连战告捷，除伊犁地区外，新疆沦陷区均告克复。这使沙皇政府处境十分尴尬，于是它一面指使白彦虎残部骚扰我国边境，力图牵制，一面则在外交上使用手段，以攫取更多利益。1878年(光绪四年)底，清政府派崇厚为出使俄国大臣，谈判归还伊犁问题。沙皇政府软硬兼施，迫使崇厚签订了屈辱的《里瓦几亚条约》，以丧失大片领土和赔款五百万卢布为代价“收回”了九座空城。消息传到国内，舆论大哗。左宗棠也极为愤慨，他痛斥崇厚的卖国行径，指出：“武事不竞之秋，有割地求和者矣。兹一矢未闻加遗，乃遽议捐弃要地，餍其所欲，譬犹投犬以骨，骨尽而噬仍不止。目前之患既然，异日之忧何极?此可为叹息痛恨者矣!”
此外，左宗棠还指出，《崇约》未经清廷批准，对中国不生效力，可以推翻。迫于舆论，清政府将崇厚治罪，判为斩监候，拒绝批准《崇约》并改派驻英、法公使曾纪泽前往圣彼得堡重新谈判，同时命左宗棠统筹兵事，为可能的战争做准备。
影响
清朝在战争中获胜，使一部分反叛清廷自甘陕入疆投靠阿古柏的穆斯林离开新疆，往中亚地区迁移。这次民族的迁移促成了今日的东干族的出现。另外，促成新疆建省。
