历史背景
提到“嘉定三屠”，还需从“剃发令”说起。对于让汉人剃头从满制，清王朝本是相当谨慎的。弘光朝投降，豫亲王多铎进入南京之后，曾有这样的公告：“剃头一事，本朝相沿成俗。今大兵所到，剃武不剃文，剃兵不剃民，尔等毋得不道法度，自行剃之。前有无耻官先剃求见，本国已经唾骂。特示。”
嘉定三屠
然而，不久之后，这项政策却发生了180度转变。这里面有两个原因：一是政局出人意料地进展迅速，江南半壁臣服，除了东南西南，满清基本已控制了整个中原，安抚之策已达到目的;二是汉人官员的推波助澜，一些业已归顺的官员们虽换了主子，倒也不甘寂寞，或自动剃发，以示忠心不二;或上书建议，以媚上谋取赏识。满清感觉名正言顺地推行满制的时机已成熟，疑虑之心消除。六月，清军再下剃发令，命令十天之内，江南人民一律剃头，“留头不留发，留发不留头”。
但是，“身体发肤，受之父母，不敢毁伤，孝之始也。”孔子、孟子的儒家思想已经影响了古人两千多年，古代汉族人哪肯实行剃发令!这必然引起大规模地反抗!书生候峒曾、黄淳耀在嘉定(今上海嘉定)揭竿而起，反抗清朝统治。
七月初一，两军会战，当地的“乡军”虽集合了十几万人，但都是平民百姓，熙熙攘攘，拥挤堵塞，属乌合之众，毫无纪律，更谈不到组织和战斗力了，李成栋虽只有不足五千兵力，但均为装备精良、训练有素的精兵。结果，侯黄的“乡军”大败。清军在嘉定开始了三次白色恐怖，嘉定三屠就此展开。
事件经过
明弘光元年(1645)五月初九，清军破南京，弘光帝南逃。三十日，县令钱默出逃。
六月二十四日，清朝授县令张维熙到任。是日，明嘉定总兵吴志葵率百人，白布裹头，昼伏东门外时家坟，晚间各持火把逼近县城，扬言捉拿张维熙，张逃之夭夭。二十七日，吴志葵再临县城，士民夹道迎接复明之师。
闰六月初七，明降将李成栋部骑兵路过境内新泾桥，大肆奸淫妇女，致死7名。初八，李成栋亲率兵船百艘、马步兵2000余名停泊县城东关，大肆奸掠。初九，李率兵去吴淞，留偏裨将梁得胜等300名守护兵船。
十二日，清军下剃发令，群情激愤，远近乡兵，竞相围攻李成栋船队。船只及所掠财物悉数焚毁，斩杀清官兵84名。
十五日，李成栋去太仓求援，行至罗店又被乡兵追杀，伤亡惨重。于是，李成栋疯狂纵兵报复，滥杀无辜。
十七日，明都察院观政、进士黄淳耀及弟渊耀，与前左通政侯峒曾及子元(玄)演、元(玄)洁倡议守城。
十八日黎明，李成栋率兵攻罗店，支洪、陆文焕率乡兵抵御。李暗遣精兵东渡练祁，西渡荻泾，乡兵背腹受敌，退入镇内。时值早市，清军入镇屠杀。居民死难1604名。
十九日，黄淳耀，侯峒曾集众公议，决定划地而守，城上高悬“嘉定恢剿义师”大旗，自制各种武器，严阵以待。
二十五日，吴志葵遣游击蔡乔率兵200余名支援嘉定，扎营城外。
次日五更，遭李成栋伏兵袭击，蔡乔战死。李成栋引兵归吴淞过新泾桥时，纵火焚屋，鸡犬不留。
七月初一，各路乡兵10万余会集砖桥与清兵决战。清兵分左右两翼冲杀，乡兵大败，被追杀不计其数。李成栋部入娄塘镇后屠杀1073名，并纵兵奸淫妇女，不可名状。
初三，李成栋汇同太仓清兵攻城，日夜炮轰。
初四五更大雨滂沱，守城士民已露立三昼夜，饮食几绝，渐不能支。清兵趁机急攻，破东门涌入城内。侯峒曾仍坐镇城楼，二子急呼：“事急矣，何以为计?”侯峒曾答曰：“有死而已，所恨者枉送一城百姓耳。”急令二子离去，二子走数步又还。侯峒曾怒日;“我死国事分也，祖母在，若辈应代我奉事，恋我何为?”二子恸哭而去，至孩儿桥皆被杀。侯峒曾自沉宣家池(叶池)未死，遂被清兵杀害，东门破，城中居民纷纷奔西门逃生，而清兵截段堵杀，居民投河死者无数。
时镇守西门的黄淳耀见大势已无可挽回，遂与弟渊耀骑马至早年读书的西林庵，对僧无等曰：“大师急避，某兄弟从此辞矣!”遂索笔疾书：“遗臣黄淳耀于弘光元年七月初四日自裁于西城僧舍。呜呼!进不能宣力皇朝，退不能洁身自隐。读书寡益，学道无成。耿耿不灭，此心而已!异日寇氛复靖，中华士庶再见天日，论其世者，当知予心。”书罢，见弟渊耀已缢梁间，遂缢其侧。
南门守将张锡眉，闻城破，偕妾投水死。身留绝命诗一首：“我生不辰，侨居兹里。路远宗亲，邈隔同气。与城存亡，死亦为义。后之君子，不我遐弃。”另有守城将领龚用圆、龚用广兄弟闻城破，拥抱恸哭曰;“我祖父清白自矢，已历三世。今日苟且图存，何面日见祖宗于地下?”语罢双双自溺而死。
辰时，李成栋入城下令鸣炮屠城。小街僻巷，无不穷搜。每遇一人，大呼献宝，献若不多，连砍三刀，物尽则杀。全城刀声砉然，嚎叫之声，动地惊天。悬梁者、投井者、断肢者、血面者，被砍未死，手足犹动者不计其数。骨肉狼籍，遍地皆是。投河自溺者不下数千人。
三日后，自西门至葛隆镇，浮尸满河，行舟无处下篙。血污浮于水面，高出数分。妇女若容貌不佳者必杀，有美色者生虏，于街坊当众奸淫。若有不从，钉其手足。初六日，李成栋纠集民船300余艘，满载所掠金帛、女子、牛马猪羊驶往太仓。嘉定被屠后，葛隆、外冈、马陆、杨行等镇乡兵复聚，再议抗清，誓不反顾，并时有偷袭斩杀清兵之义举。
二十六日五更，清兵大队至葛隆，入镇后肆行屠杀，流血满地，并再屠外冈镇。
二十七日，浦峤、浦嶂率兵再屠嘉定，逢人便杀，不分老幼，所劫财物尽载太仓。
自闰六月初，嘉定人民自发起义抗清，两个月内，大小战斗十余次，民众牺牲2万余，史称“嘉定三屠”
纪念遗迹
经过李成栋的三次屠杀令，嘉定反清运动基本平息下来。关于死亡人数有不同说法，一般认为总共在5至20万人之间。朱子素《嘉定乙酉纪事》称：“以予目击冤酷，不忍无记，事非灼见，不敢增饰一语，间涉风闻，亦必寻访故旧，众口相符，然后笔之于简。后有吊古之士，哭冤魂于凄风惨月之下者，庶几得以考信也夫。”
剃发令对当时的汉人而言，心理上是难以承受的。“身体发肤受之父母，不可损伤”，这是千年以来形成的伦理观，也是一种根深蒂固的思维方式。剃发不仅有违传统，也被视为侮辱。因此这项政策不仅遭到了传统知识分子抵制，也激怒了下层民众。
在嘉定至今还能看到多处纪念侯峒曾和黄淳耀的遗迹。嘉定城西有侯黄桥，汇龙潭公园有侯黄先生纪念碑，上海大学嘉定校区的西林寺旧地址有吴玉章题写的“陶庵留碧”碑，碑背镌刻着吴玉章的七律诗：“长虹碧血气冲天，爱国英雄继千万，且喜纪元新世界，翻天覆地换人间。”在方泰有两黄先生的墓地。
相关人物
黄淳耀
嘉定三屠遇难的抗清义士——黄淳耀
黄淳耀，字蕴生，号陶庵。万历三十三年(1605年)生于嘉定，家境贫困，十岁才入私塾读书，极为刻苦，二十岁不到即有诗名，崇祯十六年(1643年)中进士，这时，明王朝已是四面楚歌，风雨飘摇，黄淳耀哀民生多艰，叹朝纲不振，恨吏治腐败，在《野人》三首中抒发强烈的情感：“野人叹息王师劳，秦贼楚贼如猥毛。攻城掠野官吏死，大江以北民嗷嗷。”“野人叹息年岁恶，池中掘井井底涸。”“野人叹息朝无人，朝中朋党如鱼鳞。”故绝意仕途，隐居嘉定城内西林庵。
侯峒曾
侯峒曾，字豫瞻，号广成，居诸翟(今闵行区)，天启中进士，历任南京兵部主事、浙江参政，南明弘光朝授左通政使，辞而未就。江南初定，清廷便下剃发易服之令，“自部文所到之日，尽使剃发，遵依者为我国之民，迟疑者同逆命之寇，必置重罪”(萧一山《清代通史》第294、295页)。弘光元年(1645年)六月，嘉定爆发数万人参加的反剃发起义，义军推举侯峒曾、黄淳耀为领袖，抗击清军，最后坚守嘉定城。
侯黄事迹
弘光元年七月四日城破后，侯与其子侯演、侯洁殉节叶池，黄和其弟黄渊耀自缢于西林庵。嘉定许多文化世家惨遭灭门之祸，龚姓自宋至明16代中，中进士13人，嘉定三屠时，龚氏后裔随侯、黄守城，一门12人殉节。陆陇其在《陶庵集》序言中说：“盖其所积者厚，所养者深矣。”钱大昕《黄陶庵像赞》曰：“儒者之勇，可师百世，”表示对先贤的敬仰之情。
嘉定人民怀念他们，民国23年(1934年)7月23日，县志筹备委员会举行第七次会议，议决锡沪路西门外练祁河桥，改名侯黄桥，以纪念侯峒曾、黄淳耀。民国25年4月20日，在汇龙潭东岸举行“明忠节侯侯黄二先生纪念碑”奠基典礼，并于11月6日举行揭幕仪式。5月1日起修整叶池。
建国后，嘉定县人民委员会1961年勒石于叶池旧址，魏文伯书“叶池”二字，1962年在西林庵立碑，吴玉章书“陶庵留碧”。民国22年，嘉定的学校把每年5月定为实施民族教育运动月，教师讲述“倭寇侵城”、“嘉定三屠”、“三三纪念”(民国21年3月3日日军侵占嘉定城)等御侮战事，激发学生大无畏的民族精神。普通小学，由中华职业教育社系的乡绅和民族资本家创办，重视读书和就业相结合，注意培育民族意识。学校设一门乡土课，讲释本县的地域、历史、物产、文化和民风习俗，使学生从小就知道嘉定人民在明代抗倭和清初“三屠”中壮烈的史实。
每年清明祭祀之日，师生凭吊侯黄两位先生殉节的“叶池”和“西林庵”。这些乡土人事，使大家朦胧地产生了崇敬民族英雄的思想，为嘉定有这些民族英雄而感到自豪。侯黄二先生明朝末年，清军大举南下，江南各地人民在一批富有民族气节的知识分子的感召下，纷纷组织抗清力量，掀起了一场悲壮激烈的大搏杀。
“嘉定三屠”与“扬州十日”是当时最为著名的历史事件。侯峒曾、黄淳耀就是“嘉定三屠”中最杰出的英雄。侯峒曾，明天启五年(1625)进士，授南部武选主事官职，后任南方文选主事。在政治上，他倾向和同情当时的复社。有人诬陷复社领袖张溥，侯峒曾为他辩解。后来，他又出任稽勋郎、浙江右参政，分管嘉兴、湖州两府。不久，又擢升顺天府丞，因京城被李自成攻破，未赴任。侯峒曾为人正直，为官廉洁，在任南部文选主事时，被誉为“南部三清”之一。
清顺治二年(1645)，清军攻陷南京后，兵临嘉定。嘉定爆发了十多万人参加的反剃发的起义。清军总兵李成栋闻讯，紧急调兵前来镇压。途中，清军的兵船被嘉定组织的乡兵一举烧毁。从而揭开了嘉定民众抗清斗争的序幕。侯峒曾与同乡进士黄醇耀、黄渊耀兄弟，上海举人张锡眉，国子生朱长，秀才马元调、龚用圆等奋起抗清守城。他们在嘉定城楼上竖起“嘉定恢剿义师”的大旗，在四城门布置守城兵力，义师在北门仓桥炮击清兵，打死清将李成栋之弟李成林，又一次激怒了李成栋。守城抗清战斗，自六月十四之后更加激烈。
七月初四凌晨，大雨如注，守城义军饥困交加，在清兵的猛攻下东门先被破，经过激烈的巷战，嘉定城彻底告破。城破后，侯峒曾携两子玄演、玄洁奔回家中，投叶池殉国。由于池水太浅未淹死，父子三人被追来的清兵砍死。黄淳耀，年少时家贫，粗茶淡饭，到10岁时才入私塾读书，十分努力刻苦，加上天资聪明，不到20岁已诗文出众，受到“嘉定四先生”中程嘉燧的欣赏，并推荐给常熟大诗人钱谦益家执教蒙馆。黄淳耀十分痛恨华而不实的八股文，与门人陆元辅组织直言社，倡导经世之用、言之有物的文章，名重一时。
崇祯十六年(1642)考中进士，但对腐败的明王朝他已失去信心，无意仕途，回到故乡，隐居在城西西林寺，著书立说，以诗文自娱。清军逼近嘉定时，黄淳耀与候峒曾一起率嘉定义士守城，七月四日城破后，他偕弟黄渊耀回西林寺，准备自缢殉国。
西林寺僧人无等法师劝他：“你虽中进士，但并没有做官，不必殉国。”黄淳耀心意坚决，回答道：“我在起兵时就发誓与城共存亡，如今城已破，我岂能食言。”他让无等法师帮他取来笔墨，在墙上奋笔疾书：“弘光元年，七月初四日，进士黄淳耀自裁于西城僧舍。呜呼!进不能宣力皇朝，退不能洁身自隐。读书寡益，学道无成，耿耿不灭，此心而已!异日夷氛复靖，中华士庶，在见天日，论其世者，当知予心!”书毕，与弟渊耀双双自缢，年仅40岁。
据光绪《嘉定县志》记载，黄氏兄弟自缢后，对面墙上染着黄淳耀口中喷出的一片血迹，艳如桃花，灿若火焰。无等法师含泪用笔在一旁写下“留碧”两字。黄淳耀是明末著名文学家，诗文风格清新雄健，充满生活气息。清代著名学者纪晓岚评其诗“浑然天成，绝无懦响”。黄淳耀崇拜陶渊明，故有陶庵号，文章质朴淡雅，如《李龙眠画罗汉记》、《顽山赋》等脍炙人口的佳作，至今仍被人推崇，有的还入选学生课本。侯黄两先生的义节，深深地感动着后人，在嘉定至今还能看到多处纪念侯黄两先生的遗迹。
